上海自贸区建设对从事服务贸易的企业和金融机构的影响较大，港口航运和物流企业也会直接受益;由于实行“负面清单”管理和国民待遇，自贸区对外资企业很有吸引力;自贸区对区内和周边基础建设和航空物流拉动会比较明显。
一、上海自贸区初具规模富有活力
上海自贸区是中国大陆规模最大、实力最强的保税区，其GDI工业总产值、运输量、利税等经济指标大于国内其他14个保税区的总和。日本的佳能、松下、美能达、JVC、美国的通用电气、宝利来、施乐；德国的金钟-默勒等均在这里设立了分中心。
据悉，外高桥物流基地建设采取两翼展开、全面推进的方略。北区，依托外高桥港区，以发展海运物流为主，扩建方圆1.2平方公里的现代国际物流园区，为中外物流企业提供一个集装箱快速集并、中转、分拣、分送的全方位的高效服务平台；南区，以园区跨国公司高科技产品出口加工业为支撑，依托浦东国际机场，发展空运物流。
二、上海自贸区航空物流存在的问题与制约因素
1.上海自贸区存在的问题。首先是航空物流业务需求量小，尚未达到规模效益的要求。自贸区物流业的发展前景从根本上说取决于保税区物流企业的现状与未来，而保税区物流企业生存与发展的关键在于要形成具有规模效益的物流量。
其次，航空物流服务的水平还需要进一步提高。目前，上海自贸区管委会及所属机构虽然在为区内企业提供服务方面作了大量工作，但从总体上看，与物流相关的服务方面还存在一定的问题。
第三，自贸区内外的航空物流网络缺乏有效衔接。在吸引新的航空物流企业进入保税区的过程中，大多数保税区没有注意使保税区内的航空物流网络与区外的物流网络以及腹地的航空物流网络很好地相互对接，建立紧密的协作关系。
第四，自贸区内设施条件仍不能满足国际航空物流发展的需要，比如现代航空物流业要求的具有完善物流信息平台的综合物流系统还没有很好地形成。
2.上海自贸区制约航空物流因素。一是由于有关部门对上海自贸区的认识及政策条文的理解不完全一致，自贸区的政策优势实际上并未得到充分落实，这必然会影响到上海自贸区航空物流的发展。
二是航空物流运作涉及到交通运输、邮电通讯、商业物资和对外贸易等若干个行业部门，自贸区的运作还要涉及到海关和上海自贸区管理部门，由于管理体制改革的滞后，部门分割、条块分割、政企不分的状况依然存在，适应物流业发展的管理体制尚未建立起来，航空物流业的发展受到制约。
三是上海自贸区海关监管制度建设滞后。首先是上海自贸区海关管理法制建设不健全。一些过时的法规没有及时废止；正在执行的一些法规不够透明。其次是海关通关效率不高。对一般贸易进口货物的验放，海关的现行做法是先税后放，申报、查验、征税等手续都在口岸现场完成，大量货物进出口影响了口岸通过，形成了“口岸瓶颈”。
三、进一步发展航空物流的战略措施
1.构筑和完善以多式联运体系为核心的国际航空物流。国际多式联运系统是指在国际运输中灵活运用各种运输形式所具有的安全、准时、大量、高速、舒适等特性，综合组织成为最有效和最适合运输需求的综合物流运输系统，即由一个承运人负责将多种运输方式综合与集成，以最好的服务、最快的速度、最具竞争力的价格实现“门到门”运输。
2.建立国际航空物流信息交易系统。随着国际航空物流信息化趋势的推进，保税区要加快建立国际物流信息交易系统，确保全天候地与国际互联网沟通，以满足国际航空物流运作的需要。
3.鼓励保税区内航空物流企业发展第三方物流。第三方物流是物流服务供给方在特定的时间段内按特定的价格向需求方提供个性化系列物流服务的交易方式，这种物流服务是建立在现代电子信息技术基础上的。物流活动和配送工作由专业的物流公司或储运公司来完成，由于不参与商品的买卖，只提供专门的物流服务，因此是独立于买方和卖方的第三方，故称“第三方物流”。
4.发挥自贸区管委会作用，积极发展第四方航空物流。埃森哲公司最早提出了第四方物流的4PL的概念：“第四方物流供应商是一个供应链的集成商，它对公司内部和具有互补性的服务供应商所拥有的不同资源、能力和技术进行整合和管理，提供一整套供应链解决方案。”
首先，第四方航空物流提供一整套完善的供应链解决方案，集成了管理航空物流和第三方物流服务商的能力。更重要的是，一个前所未有的、使客户价值最大化的统一的技术方案的设计、实施和运作，只有通过咨询公司、技术公司和物流公司的齐心协力才能够实现。
其次，第四方航空物流通过其对整个供应链产生影响的能力来增加价值。4PL充分利用了一批服务提供商的能力，包括3PL、信息技术供应商、合同物流供应商、呼叫中心、电信增殖服务商等等，再加上客户的能力和4PL自身的能力。
5.全面实施环保航空物流管理。国际航空物流环保化趋势日益明显，环保航空物流将备受关注。环保航空物流是指为了实现顾客满意，连接环保供给主体和环保需求主体，克服空间和时间阻碍的有效、快速的环保商品和服务流动的环境经济管理活动过程。
6.进一步营造宽松的政策环境。要率先在自贸区内实行市场准入和贸易自由化原则，取消外贸特许制，放开外贸经营权，区内的所有航空物流企业均可实行自营进出口；进一步放宽合资外贸航空物流公司的审批条件，由审批制向外贸登记制过渡；允许区内的所有外资银行经营本币业务，自由融资、自由兑换的离岸金融的试点。
7.引进和培养优秀的航空物流管理人才。物流服务包括物流资源的重新整合，包括产、供、销各个环节物流活动的重新整合，包括利用电子商务平台为客户提供高效、准确、及时的服务，包括从供应商到消费方的门到门的全程服务；物流具有上述服务能力，就必须引进国际化的航空物流服务理念、航空物流管理模式、优胜劣汰的竞争机制、国内外优秀的航空物流管理人才。特别要重视以“产学研”一体化模式培养从事航空物流理论研究与务实的专门人才。既懂IT技术又懂电子商务的网络经济人，既懂电子商务又懂现代航空物流的有创新思想的复合型人才等四类人才。
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